Микроскопско проучване на клетки които или са живи, или са били умъртвени и фиксирани за да се запази структурата им. Съществуват различни методи за идентифициране и локализиране на различни органели и молекули, какъвто метод е хистологията. Активният център на ензима може да бъде локализиран чрез използване на неговия химически, свързан с багрило специфичен субстрат; тези специфични методи на оцветяване са известни като цитохимия.